不同氮源及盐度对新月菱形藻生长繁殖的影响

生物饵料培养学课程设计
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作者

fhaoshao

日期

8/3/23

原始数据

使用Excel软件汇总各组处理的计数数量,计算三次计数的平均值,计算平均相对生长速率K值,得到原始数据。

  • K值计算公式:

\[K=\frac{lg N_{t}-lgN_{0}}{t-t_{0}}\]

式中, N0为初始细胞数目、Nt为培养7d后的细胞数、t为培养时间。

数据分析及可视化

单因素方差分析(AN-OVA)和Duncan多重比较分析(α=0.05)以及可视化均使用R(4.2.2)统计软件完成。

得出的实验数据用平均值(Mean)±标准差(SD)表示

#单因素方差分析
N_aov=aov(k~氮源,data = N_ogdata)
summary(N_aov)
            Df    Sum Sq   Mean Sq F value Pr(>F)  
氮源         1 0.0005855 0.0005855   4.601 0.0576 .
Residuals   10 0.0012726 0.0001273                 
---
Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

p值小于0.05,处理间差异显著,对处理间的差异进行Duncan多重比较分析。

salt_aov=aov(k~盐度,data = salt_ogdata)
summary(salt_aov)
            Df   Sum Sq   Mean Sq F value Pr(>F)
盐度         6 0.001239 0.0002064   0.754  0.617
Residuals   13 0.003557 0.0002736               

使用盐度原始数据单因素方差分析得的p值远大于0.05,处理间差异不显著,无法进行多重比较分析。

salt_aov1=aov(k~盐度,data = salt_newdata)
summary(salt_aov1)
            Df    Sum Sq   Mean Sq F value Pr(>F)  
盐度         6 0.0004774 7.957e-05   2.864 0.0974 .
Residuals    7 0.0001945 2.778e-05                 
---
Signif. codes:  0 '***' 0.001 '**' 0.01 '*' 0.05 '.' 0.1 ' ' 1

除去原始数据中包含的变异波动较大的数据,使p值减小,进行Duncan多重比较分析。

#duncan多重检验
N_duncan=duncan.test(N_aov,"氮源")
salt_duncan=duncan.test(salt_aov1,"盐度")

#数据整理
N_data=N_ogdata%>%
  drop_na()%>%
  group_by(氮源)%>%
  summarise(avg=mean(k),sd=sd(k),n=n(),na.rm = TRUE)%>%
  mutate(labels=N_duncan$groups$groups)

salt_data=salt_newdata%>%
  group_by(盐度)%>%
  summarise(avg=mean(k),sd=sd(k),n=n(),na.rm = TRUE)%>%
  mutate(labels=salt_duncan$groups$groups)

N_data
# A tibble: 4 × 6
   氮源   avg      sd     n na.rm labels
  <dbl> <dbl>   <dbl> <int> <lgl> <chr> 
1     1 0.223 0.00378     3 TRUE  a     
2     2 0.224 0.0130      3 TRUE  ab    
3     3 0.250 0.00291     2 TRUE  b     
4     4 0.236 0.00855     3 TRUE  b     
salt_data
# A tibble: 7 × 6
  盐度    avg      sd     n na.rm labels
  <fct> <dbl>   <dbl> <int> <lgl> <chr> 
1 5     0.168 0.00536     2 TRUE  a     
2 10    0.164 0.00143     2 TRUE  ab    
3 15    0.167 0.00188     2 TRUE  ab    
4 20    0.176 0.00219     2 TRUE  ab    
5 25    0.181 0.0106      2 TRUE  ab    
6 30    0.166 0.00183     2 TRUE  b     
7 35    0.176 0.00638     2 TRUE  b     

使用ggplot2包绘制实验结果图。

结果分析